我们日常饮用水都是要经过消毒加工的。因为现在科技发达，水污染源越来越多，甚至地面水都会受到工业污水废水的污染，在很多没有消毒的水域里细菌多的惊人，尤其是大肠杆菌数量竟达到数万个以上。如果消毒程序比较简单只是单纯过滤的话，在原水表面吸附着的悬浮物、比较大面积的细菌是能够除去的，但是这样的消毒方法根本不彻底，对人体有伤害的微生物是清除不掉的。
为了防止疾病的传播，保障人民的健康，现在国家出台很多关于原水消毒的规定，必须要对日常饮水进行消毒，彻底消灭掉水中伤害人体的病毒。现在直饮水机盛行的原因之一就是因为这种饮水机的消毒工艺很正规，在工业冷却水处理的过程中，杜绝循环水产生生物黏泥。即使是循环水系统补充水的过滤水也必须要经过杀菌消毒的处理，这样一来人们饮用的水就完全符合标准饮用规格。
大家都知道在原水消毒的过程中除去水的颜色以及气味是非常重要的，但是很多不正规的消毒方法只是会消除掉水的颜色，甚至气味都消除不了，这种水如果因为是会对身体造成大程度伤害的。直饮水机坚决防止离子交换树脂受到有毒微生物的污染，所以在对原水的消毒杀菌上也有讲究。这种绝对严格的消毒方法得到众多用户的认可。
为了保证饮用水的安全，直饮水机的消毒管理方法是很严格的，首先在进行直饮水系统冲洗之前必须要对机器内的仪表进行保护，在冲洗时候尽量先用短管替代，这样才能让整个消毒过程更加严格。直饮水消毒管道冲洗大多是采用自来水，流速很大能够保证冲洗过程中每个环节都收到冲洗。为了保证呢个冲洗水能够彻底排出来，系统还必须要设置最低点。直饮水采用二氧化氯的生厂设备进行消毒，这种消毒方法自动化程度很高，采用二氧化硫消毒不会影响到消毒之后水的口感，所以直饮水机中出来的日常饮用水味道甘甜。
目前，专家推崇的紫外线消毒方法也被直饮水机所利用。使用紫外线消毒器消毒就能够省去一笔资金，不用再花大价钱使用臭氧或者是二氧化氯作为消毒设备了，在节省资金的同时必须要保证消毒效果。最重要的是水质量要好，要对人体健康有益。