水源保护是一个庞大的系统工程。首先应理顺管理体制，目前这种管“量”不管“质”或管“质”不管“量”的分工应予改变，设立统一的权威管理机构；其次，饮用水安全涉及全民身心的健康，水环境的保护应放在战略位置，对水源能造成污染的废水废渣必须严格达标排放，对造成污染者应克以重罚。
全自动过滤器贯穿城镇供水水质污染事故，就其发生的部位可分为原水水质污染事故和管网水水质污染事故两大类，不论哪种污染若得不到及时处理，都将影响正常供水，进而影响社会生活秩序。切实加强水源保护和水源污染的防治刻不容缓。
在城镇总体规划中应明确划定饮水水源，制订专门的饮用水水源水质标准和水源地管理法规；对于水源防护区和输水渠道沿线也应有严格的防护，沿线交通道路应杜绝大型车辆尤其是运输危险品车辆通行，防范突发事故；在必要的地区和输水渠道沿线应设立监视和监测网点，对于生命线工程再严格也不为过。
基于地表水与地下水水源不同程度被污染的现状，我们必须进一步了解饮用水水源中所含污染物的种类、来源和特性，包括无机化合物、合成有机化合物、微生物以及环境激素的污染。基于污染并非短时间内完全得以控制，以及新的饮用水卫生标准的推出和执行，水质处理技术面对着诸多课题，这也是供水企业当前非常紧迫的任务；远距离调水的实施以及地表水与地下水的切换，也对城市供水管网水质提出了重要课题。上述问题都是传统处理工艺不能完全奏效的，因此不断推进先进净水技术以及开展具有前瞻性技术贮备的工作刻不容缓。
水源污染严重的现实以及新的污染物的不断出现，也对水质检测的方法和手段提出了新的要求，需要建立愈加完善的监督、检测机制。实践证明，对监督城镇供水水质的日常运行、提高监测水平、以及确保水质安全有着突出的作用。
城市供水的首要任务是保证不间断供水，这就需要有完善的全自动过滤器处理工艺来保证供水水质，要有“足够的供水能力”保证日常全部需要以及应对一般事故和突发事故的急需。为此城市供水应具有较高的“供水保证率”。我国城市供水则较低，我们的城市供水安全保障不高，值得警惕。要重视水质的安全，还要重视供水量的安全，实际上水质事故造成停水最终也反映在供水量上。
提高供水保证率，就需科学合理地规划和建设足够的全自动过滤器供水设施；其前提是要有足够的水源保证；要有充分的输配水的调配能力；要有适度的水厂与管网中的调蓄能力；还需要建立一个与其适应的运营管理机制。
总之，全自动过滤器饮用水安全问题，关系到每一个人的健康和社会的和谐稳定。随着经济的快速发展，工业化进程的加快，环境污染问题日益凸显，过滤饮用水安全更需要倍加关注。